context("Tree of Life API") ############################################################################ ## .tol_about ## ############################################################################ test_that("include_source_list is logical for .tol_about", { skip_on_cran() expect_error( .tol_about("true"), "logical" ) }) ############################################################################ ## .tol_mrca ## ############################################################################ test_that("neither ott_ids nor node_ids are NULL for .tol_mrca", { skip_on_cran() expect_error( .tol_mrca(NULL), "Must provide" ) }) ############################################################################ ## .tol_subtree ## ############################################################################ test_that("ott_id is not NULL", { skip_on_cran() expect_error( .tol_subtree(ott_id = NULL, node_id = NULL), "Must provide" ) }) ############################################################################ ## .tol_induced_subtree ## ############################################################################ test_that("ott_ids is not NULL", { skip_on_cran() expect_error( .tol_induced_subtree(ott_ids = NULL), "Must provide" ) }) test_that("NAs are not accepted for ott_ids", { skip_on_cran() expect_error( .tol_induced_subtree(ott_ids = c(123, NA, 456)), "NAs are not allowed" ) }) #################### ## .tol_node_info ## #################### test_that("include_lineage must be logical with .tol_node_info", { skip_on_cran() expect_error( .tol_node_info(ott_id = "ott_123", include_lineage = "123"), "logical" ) }) test_that("ott_id must be a numeric with .tol_node_info", { skip_on_cran() expect_error( .tol_node_info(ott_id = "test"), "look like numbers" ) }) test_that("node_id must be a character with .tol_node_info", { skip_on_cran() expect_error( .tol_node_info(node_id = 123), "must look like" ) })