R Under development (unstable) (2025-07-07 r88391 ucrt) -- "Unsuffered Consequences" Copyright (C) 2025 The R Foundation for Statistical Computing Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY. You are welcome to redistribute it under certain conditions. Type 'license()' or 'licence()' for distribution details. R is a collaborative project with many contributors. Type 'contributors()' for more information and 'citation()' on how to cite R or R packages in publications. Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or 'help.start()' for an HTML browser interface to help. Type 'q()' to quit R. > library(testthat) > library(projpred) This is projpred version 2.9.0. > > test_check("projpred") Warning in eval(exprs, env) : On CRAN, projpred's tests based on rstanarm fits are avoided due to possible incompatibility issues between packages 'Matrix' and 'lme4' (see inline comment for this warning message). Deactivating the rstanarm tests now. Furthermore, in this case, `run_prj`, `run_vs`, and `run_cvvs` are currently set to `FALSE`. [ FAIL 0 | WARN 0 | SKIP 171 | PASS 741 ] ══ Skipped tests (171) ═════════════════════════════════════════════════════════ • !is.null(args_fit_i) is not TRUE (4): 'test_refmodel.R:82:3', 'test_refmodel.R:106:3', 'test_refmodel.R:161:3', 'test_refmodel.R:175:3' • On CRAN (7): 'test_datafit.R:608:3', 'test_div_minimizer.R:11:3', 'test_div_minimizer.R:97:3', 'test_div_minimizer.R:226:3', 'test_methods_vsel.R:715:3', 'test_misc.R:127:3', 'test_proj_predfun.R:10:3' • empty test (11): 'test_datafit.R:196:1', 'test_datafit.R:224:1', 'test_datafit.R:487:1', 'test_misc.R:7:1', 'test_misc.R:37:1', 'test_refmodel.R:5:1', 'test_refmodel.R:201:1', 'test_refmodel.R:225:1', 'test_varsel.R:36:1', 'test_varsel.R:1215:1', 'test_varsel.R:1237:1' • length(fits) > 0 is not TRUE (4): 'test_project.R:301:3', 'test_refmodel.R:214:3', 'test_refmodel.R:220:3', 'test_varsel.R:1596:3' • run_cvvs is not TRUE (39): 'test_augdat.R:437:3', 'test_augdat.R:495:3', 'test_augdat.R:565:3', 'test_datafit.R:273:3', 'test_datafit.R:555:3', 'test_methods_vsel.R:103:3', 'test_methods_vsel.R:142:3', 'test_methods_vsel.R:213:3', 'test_methods_vsel.R:264:3', 'test_methods_vsel.R:386:3', 'test_methods_vsel.R:508:3', 'test_methods_vsel.R:625:3', 'test_methods_vsel.R:652:3', 'test_methods_vsel.R:677:3', 'test_methods_vsel.R:746:3', 'test_methods_vsel.R:756:3', 'test_proj_pred.R:93:3', 'test_proj_pred.R:231:3', 'test_proj_pred.R:1166:3', 'test_proj_pred.R:1279:3', 'test_project.R:209:3', 'test_varsel.R:1179:3', 'test_varsel.R:1246:3', 'test_varsel.R:1284:3', 'test_varsel.R:1386:3', 'test_varsel.R:1413:3', 'test_varsel.R:1436:3', 'test_varsel.R:1479:3', 'test_varsel.R:1613:3', 'test_varsel.R:1726:3', 'test_varsel.R:1855:3', 'test_varsel.R:1890:3', 'test_varsel.R:2057:3', 'test_varsel.R:2125:3', 'test_varsel.R:2185:3', 'test_varsel.R:2248:3', 'test_varsel.R:2456:3', 'test_varsel.R:2555:3', 'test_varsel.R:2636:3' • run_prj is not TRUE (50): 'test_as_matrix.R:4:3', 'test_as_matrix.R:236:3', 'test_as_matrix.R:252:3', 'test_as_matrix.R:278:3', 'test_as_matrix.R:298:3', 'test_augdat.R:190:3', 'test_augdat.R:227:3', 'test_augdat.R:253:3', 'test_augdat.R:286:3', 'test_datafit.R:302:3', 'test_latent.R:65:3', 'test_latent.R:79:3', 'test_latent.R:103:3', 'test_latent.R:166:3', 'test_proj_pred.R:8:3', 'test_proj_pred.R:142:3', 'test_proj_pred.R:170:3', 'test_proj_pred.R:189:3', 'test_proj_pred.R:288:3', 'test_proj_pred.R:306:3', 'test_proj_pred.R:387:3', 'test_proj_pred.R:439:3', 'test_proj_pred.R:497:3', 'test_proj_pred.R:607:3', 'test_proj_pred.R:761:3', 'test_proj_pred.R:822:3', 'test_proj_pred.R:860:3', 'test_proj_pred.R:955:3', 'test_proj_pred.R:1004:3', 'test_proj_pred.R:1021:3', 'test_proj_pred.R:1075:3', 'test_proj_pred.R:1108:3', 'test_proj_pred.R:1200:3', 'test_proj_pred.R:1218:3', 'test_proj_pred.R:1237:3', 'test_proj_pred.R:1336:3', 'test_proj_pred.R:1356:3', 'test_proj_pred.R:1402:3', 'test_proj_pred.R:1433:3', 'test_proj_pred.R:1465:3', 'test_proj_pred.R:1564:3', 'test_proj_pred.R:1667:3', 'test_proj_pred.R:1744:3', 'test_proj_pred.R:1789:3', 'test_project.R:9:3', 'test_project.R:23:3', 'test_project.R:95:3', 'test_project.R:335:3', 'test_project.R:394:3', 'test_project.R:430:3' • run_prll is not TRUE (3): 'test_parallel.R:31:3', 'test_parallel.R:47:3', 'test_parallel.R:63:3' • run_vs is not TRUE (53): 'test_augdat.R:319:3', 'test_augdat.R:362:3', 'test_augdat.R:394:3', 'test_datafit.R:240:3', 'test_datafit.R:328:3', 'test_datafit.R:402:3', 'test_datafit.R:448:3', 'test_datafit.R:499:3', 'test_datafit.R:514:3', 'test_methods_vsel.R:41:3', 'test_methods_vsel.R:67:3', 'test_methods_vsel.R:79:3', 'test_methods_vsel.R:130:3', 'test_methods_vsel.R:154:3', 'test_methods_vsel.R:191:3', 'test_methods_vsel.R:239:3', 'test_methods_vsel.R:304:3', 'test_methods_vsel.R:450:3', 'test_methods_vsel.R:461:3', 'test_methods_vsel.R:474:3', 'test_methods_vsel.R:545:3', 'test_methods_vsel.R:556:3', 'test_methods_vsel.R:610:3', 'test_methods_vsel.R:644:3', 'test_proj_pred.R:44:3', 'test_proj_pred.R:209:3', 'test_proj_pred.R:887:3', 'test_proj_pred.R:1132:3', 'test_proj_pred.R:1257:3', 'test_proj_pred.R:1692:3', 'test_project.R:114:3', 'test_project.R:317:3', 'test_varsel.R:9:3', 'test_varsel.R:59:3', 'test_varsel.R:86:3', 'test_varsel.R:183:3', 'test_varsel.R:504:3', 'test_varsel.R:647:3', 'test_varsel.R:724:3', 'test_varsel.R:848:3', 'test_varsel.R:875:3', 'test_varsel.R:897:3', 'test_varsel.R:960:3', 'test_varsel.R:1033:3', 'test_varsel.R:1048:3', 'test_varsel.R:1063:3', 'test_varsel.R:1074:3', 'test_varsel.R:1087:3', 'test_varsel.R:1124:3', 'test_varsel.R:1945:3', 'test_varsel.R:1997:3', 'test_varsel.R:2314:3', 'test_varsel.R:2379:3' [ FAIL 0 | WARN 0 | SKIP 171 | PASS 741 ] > > proc.time() user system elapsed 81.17 1.17 82.34