nmTest({ test_that("focei 429", { pk.turnover.emax.lag <- function() { ini({ talag <- c(0,0.1) tka <- log(1) tcl <- log(0.1) tv <- log(10) ## eta.ka ~ 1 eta.cl ~ 2 eta.v ~ 1 prop.err <- 0.1 pkadd.err <- 0.1 ## poplogit <- 2 #temax <- 7.5 tec50 <- log(0.5) tkout <- log(0.05) te0 <- log(100) ## eta.emax ~ .5 eta.ec50 ~ .5 eta.kout ~ .5 eta.e0 ~ .5 ## pdadd.err <- 10 }) model({ ka <- exp(tka + eta.ka) cl <- exp(tcl + eta.cl) v <- exp(tv + eta.v) alag1 <- talag ## #poplogit = log(temax/(1-temax)) logit=exp(poplogit+eta.emax) #logit=temax+eta.emax emax = logit/(1+logit) ec50 = exp(tec50 + eta.ec50) kout = exp(tkout + eta.kout) e0 = exp(te0 + eta.e0) ## DCP = center/v PD=1-emax*DCP/(ec50+DCP) ## effect(0) = e0 kin = e0*kout ## d/dt(gut) = -ka * gut d/dt(center) = ka * gut - cl / v * center d/dt(effect) = kin*PD -kout*effect alag(gut) = alag1 ## cp = center / v cp ~ prop(prop.err) + add(pkadd.err) pca = effect pca ~ add(pdadd.err) | pca }) } expect_error( fit.TOF <- suppressWarnings(suppressMessages(nlmixr(pk.turnover.emax.lag, warfarin, "focei", foceiControl(print=0, maxOuterIterations = 0)))), NA ) expect_s3_class(fit.TOF, "nlmixr2FitCore") }) })