library(adegraphics) pdf("s1d.gauss.pdf") data(meau, package= "ade4") envpca <- ade4::dudi.pca(meau$env, scannf = FALSE) dffac <- cbind.data.frame(meau$design$season, meau$design$site) g11 <- s1d.gauss(envpca$li[, 1], dffac[, 1]) g12 <- s1d.gauss(envpca$li[, 1], dffac[, 1], p1d.rev = TRUE) g13 <- s1d.gauss(envpca$li[, 1], dffac[, 1], p1d.hori = FALSE) g14 <- s1d.gauss(envpca$li[, 1], dffac[, 1], p1d.hori = FALSE, p1d.rev = TRUE) g2 <- s1d.gauss(envpca$li[, 1], dffac[, 1], ppoly.col = 1:4, fill = TRUE, plines.col = 1:4, col = FALSE) g31 <- s1d.gauss(envpca$li[, 1], dffac[, 2], ppoly.col = 1:4, paxes.draw = TRUE, ylim = c(0, 2), fill = TRUE, p1d.hori = FALSE) g32 <- s1d.gauss(envpca$li[, 1], dffac[, 2], ppoly.col = 1:4, paxes.draw = TRUE, fill = TRUE, p1d.hori = FALSE) g4 <- s1d.gauss(envpca$li[, 1], fac = dffac, fill = TRUE, col = 1:5) g5 <- s1d.gauss(envpca$li[, 1], fac = dffac, fill = TRUE, col = FALSE, ppoly.col = 1:6) g6 <- s1d.gauss(envpca$li[, 1], fac = dffac[, 1], fill = TRUE, col = 1:6, ppoly.col = 1:6) g7 <- s1d.gauss(envpca$li[, 1], fac = dffac, fill = TRUE, col = 1:6, ppoly.col = 1:6, steps = 10) g8 <- s1d.gauss(envpca$li[, 1], dffac[, 2]) update(g11, p1d.reverse = TRUE) update(g12, p1d.reverse = FALSE) update(g13, p1d.reverse = TRUE) update(g14, p1d.reverse = FALSE)