win-builder.r-project.org - /incoming_pretest/ICAMS_3.0.9_20250114_144624/Windows/examples_and_tests/tests/testthat/

[Zum übergeordneten Verzeichnis]

14.01.2025    15:12         2593 test_0TransformCatalogDBS144.R
14.01.2025    15:12         2620 test_0TransformCatalogSBS192.R
14.01.2025    15:12         5642 test_1strandbias_functions.R
14.01.2025    15:12        18420 test_1TransformCatalog.R
14.01.2025    15:12        16521 test_1VCFFilesToZipFile.R
14.01.2025    15:12         2185 test_AddSeqContext.R
14.01.2025    15:12         1552 test_AnnotateIDVCF.R
14.01.2025    15:12         1134 test_as.catalog.R
14.01.2025    15:12         3915 test_CanonicalizeDBS.R
14.01.2025    15:12        43981 test_cbind_catalogs.R
14.01.2025    15:12         7955 test_CheckAndFixChrNames.R
14.01.2025    15:12        11259 test_CheckAndFixChrNamesForTransRanges.R
14.01.2025    15:12         4945 test_CollapseCatalog.R
14.01.2025    15:12          510 test_COMPOSITE.R
14.01.2025    15:12         5042 test_ConvertICAMSCatalogToSigPro.R
14.01.2025    15:12         1678 test_COSMIC_signature_identity.R
14.01.2025    15:12         2585 test_DefaultFilterStatus.R
14.01.2025    15:12         5337 test_deprecated_fns.R
14.01.2025    15:12         6399 test_discarded_variants.R
14.01.2025    15:12         4905 test_extended_seq.context_functions.R
14.01.2025    15:12         1764 test_ExtendSeqContextForOnebpINDEL.R
14.01.2025    15:12         1997 test_GeneratePlotPFMmatrix.R
14.01.2025    15:12         1893 test_HaplotypePlot.R
14.01.2025    15:12         4499 test_ID_fns.R
14.01.2025    15:12         1450 test_IsICAMSCatalog.R
14.01.2025    15:12         1785 test_MakeCatalogFromMutectGRCh38VCF.R
14.01.2025    15:12         3212 test_MakeCatalogFromStrelkaGRCh38VCF.R
14.01.2025    15:12         5784 test_methods_for_subsetting_catalogs.R
14.01.2025    15:12         5443 test_parallel_computing.R
14.01.2025    15:12         1553 test_PlotCatalog.DBS136Catalog.R
14.01.2025    15:12         1906 test_PlotCatalog.DBS144Catalog.R
14.01.2025    15:12         1489 test_PlotCatalog.DBS78Catalog.R
14.01.2025    15:12         1113 test_PlotCatalog.IndelCatalog.R
14.01.2025    15:12         1393 test_PlotCatalog.SBS1536Catalog.R
14.01.2025    15:12         2702 test_PlotCatalog.SBS192Catalog.R
14.01.2025    15:12         7575 test_PlotCatalog.SBS96Catalog.R
14.01.2025    15:12         1402 test_PlotCatalog_for_matrix_like_object.R
14.01.2025    15:12         1207 test_PlotCatalogToPdf.DBS136Catalog.R
14.01.2025    15:12         3332 test_PlotCatalogToPdf.DBS144Catalog.R
14.01.2025    15:12         2109 test_PlotCatalogToPdf.DBS78Catalog.R
14.01.2025    15:12         1794 test_PlotCatalogToPdf.IndelCatalog.R
14.01.2025    15:12         2160 test_PlotCatalogToPdf.SBS1536Catalog.R
14.01.2025    15:12         5520 test_PlotCatalogToPdf.SBS192Catalog.R
14.01.2025    15:12         3181 test_PlotCatalogToPdf.SBS96Catalog.R
14.01.2025    15:12         2185 test_PlotCatalogToPdf_for_matrix_like_object.R
14.01.2025    15:12         5870 test_processing_empty_vcfs.R
14.01.2025    15:12          194 test_PyrPenta.R
14.01.2025    15:12        10631 test_Read_and_Split_VCFs.R
14.01.2025    15:12         1779 test_ReadCatalog.R
14.01.2025    15:12          815 test_ReadCatalogError.R
14.01.2025    15:12          181 test_ReadStrelkaSBSVCF.R
14.01.2025    15:12         8759 test_ReadVCF.R
14.01.2025    15:12          286 test_ReadVCFError.R
14.01.2025    15:12         1297 test_ReadWriteCatalog.R
14.01.2025    15:12          131 test_RevcDBS144.R
14.01.2025    15:12          128 test_RevcSBS96.R
14.01.2025    15:12         7909 test_SelectVariantsByChromName.R
14.01.2025    15:12          792 test_SigProfiler_formats.R
14.01.2025    15:12          366 test_SplitStrelkaVCF.R
14.01.2025    15:12          980 test_TransRownames.ID.PCAWG.SigPro.R
14.01.2025    15:12          751 test_VCF_variant_caller_unknown.R
14.01.2025    15:12         2379 test_VCFsToCatalogAndPlotToPdf.R
14.01.2025    15:12         5203 test_VCFsToCatalogs.R
14.01.2025    15:12        <dir> testdata