win-builder.r-project.org - /incoming_pretest/ICAMS_3.0.10_20250209_134624/Windows/examples_and_tests/tests/testthat/


[Zum übergeordneten Verzeichnis]

09.02.2025 14:07 2593 test_0TransformCatalogDBS144.R
09.02.2025 14:07 2620 test_0TransformCatalogSBS192.R
09.02.2025 14:07 5642 test_1strandbias_functions.R
09.02.2025 14:07 18420 test_1TransformCatalog.R
09.02.2025 14:07 16521 test_1VCFFilesToZipFile.R
09.02.2025 14:07 2185 test_AddSeqContext.R
09.02.2025 14:07 1552 test_AnnotateIDVCF.R
09.02.2025 14:07 1134 test_as.catalog.R
09.02.2025 14:07 3915 test_CanonicalizeDBS.R
09.02.2025 14:07 43981 test_cbind_catalogs.R
09.02.2025 14:07 7955 test_CheckAndFixChrNames.R
09.02.2025 14:07 11259 test_CheckAndFixChrNamesForTransRanges.R
09.02.2025 14:07 4945 test_CollapseCatalog.R
09.02.2025 14:07 510 test_COMPOSITE.R
09.02.2025 14:07 5042 test_ConvertICAMSCatalogToSigPro.R
09.02.2025 14:07 1678 test_COSMIC_signature_identity.R
09.02.2025 14:07 2585 test_DefaultFilterStatus.R
09.02.2025 14:07 5337 test_deprecated_fns.R
09.02.2025 14:07 6399 test_discarded_variants.R
09.02.2025 14:07 4905 test_extended_seq.context_functions.R
09.02.2025 14:07 1764 test_ExtendSeqContextForOnebpINDEL.R
09.02.2025 14:07 1997 test_GeneratePlotPFMmatrix.R
09.02.2025 14:07 1893 test_HaplotypePlot.R
09.02.2025 14:07 4499 test_ID_fns.R
09.02.2025 14:07 1450 test_IsICAMSCatalog.R
09.02.2025 14:07 1785 test_MakeCatalogFromMutectGRCh38VCF.R
09.02.2025 14:07 3212 test_MakeCatalogFromStrelkaGRCh38VCF.R
09.02.2025 14:07 5784 test_methods_for_subsetting_catalogs.R
09.02.2025 14:07 5443 test_parallel_computing.R
09.02.2025 14:07 1553 test_PlotCatalog.DBS136Catalog.R
09.02.2025 14:07 1906 test_PlotCatalog.DBS144Catalog.R
09.02.2025 14:07 1489 test_PlotCatalog.DBS78Catalog.R
09.02.2025 14:07 1113 test_PlotCatalog.IndelCatalog.R
09.02.2025 14:07 1393 test_PlotCatalog.SBS1536Catalog.R
09.02.2025 14:07 2702 test_PlotCatalog.SBS192Catalog.R
09.02.2025 14:07 7575 test_PlotCatalog.SBS96Catalog.R
09.02.2025 14:07 1402 test_PlotCatalog_for_matrix_like_object.R
09.02.2025 14:07 1207 test_PlotCatalogToPdf.DBS136Catalog.R
09.02.2025 14:07 3332 test_PlotCatalogToPdf.DBS144Catalog.R
09.02.2025 14:07 2109 test_PlotCatalogToPdf.DBS78Catalog.R
09.02.2025 14:07 1794 test_PlotCatalogToPdf.IndelCatalog.R
09.02.2025 14:07 2160 test_PlotCatalogToPdf.SBS1536Catalog.R
09.02.2025 14:07 5520 test_PlotCatalogToPdf.SBS192Catalog.R
09.02.2025 14:07 3181 test_PlotCatalogToPdf.SBS96Catalog.R
09.02.2025 14:07 2185 test_PlotCatalogToPdf_for_matrix_like_object.R
09.02.2025 14:07 5870 test_processing_empty_vcfs.R
09.02.2025 14:07 194 test_PyrPenta.R
09.02.2025 14:07 10631 test_Read_and_Split_VCFs.R
09.02.2025 14:07 1779 test_ReadCatalog.R
09.02.2025 14:07 815 test_ReadCatalogError.R
09.02.2025 14:07 181 test_ReadStrelkaSBSVCF.R
09.02.2025 14:07 8759 test_ReadVCF.R
09.02.2025 14:07 286 test_ReadVCFError.R
09.02.2025 14:07 1297 test_ReadWriteCatalog.R
09.02.2025 14:07 131 test_RevcDBS144.R
09.02.2025 14:07 128 test_RevcSBS96.R
09.02.2025 14:07 7909 test_SelectVariantsByChromName.R
09.02.2025 14:07 792 test_SigProfiler_formats.R
09.02.2025 14:07 366 test_SplitStrelkaVCF.R
09.02.2025 14:07 980 test_TransRownames.ID.PCAWG.SigPro.R
09.02.2025 14:07 751 test_VCF_variant_caller_unknown.R
09.02.2025 14:07 2379 test_VCFsToCatalogAndPlotToPdf.R
09.02.2025 14:07 5203 test_VCFsToCatalogs.R
09.02.2025 14:07 <dir> testdata